常见的有pH值过低、温度过低等原因，如果种苗老叶上有坏死斑点、焦边，或者是生长点坏死，是pH值过低，如果低于6.0，还容易导致镁、铁、钠、锌等微量元素过量，解决的方法是，要让pH值保持在6.0～6.7之间，具体可用38kg水加入0.4526kg石灰结合浇水进行调节。
以上其实只是一个石灰水配比法，可按这个配比灵活配置。温度过低时培育墨西哥黄菊花苗，容易发生疫病，具体表现为，初期茎基部水渍状，进而会坏死倒伏。所以在育苗中要保持恒定的适宜温度，还要控制好湿度，预防病害发生。还要保证不缺水、不缺肥，否则会使植株瘦弱，形成小老苗。
炼苗期给予充足的阳光（避免直射，必要时遮阴），本身就是阳性的墨西哥黄菊花生长、开花需求特性，也可以避免上盆后在充足的光照下出现不良反应。待上盆后温度先保持在18℃，过几周后要降到15℃，这种温度一直到开花前，到花蕾绽放和花期，温度要降至12～14℃。这是墨西哥黄菊花最理想的生长、开花温度，也能保证发育成良好的株型。但在现实中，一般没有这样精心呵护黄菊花生长、开花的人，所以都是粗放型的管护方法，也就是刚开篇说的高于5℃，防止冻害，保持在10～30℃生长、开花。